לעמותת טופז מספר שותפויות מתמשכות, כאשר העיקריות שביניהן:
המודל החברתי ישראלי – עמותה העוסקת ביזמות שכפול. שותפה עם טופז להפעלה של חממת אימפקטוב.
ברית עולם – עמותה העוסקת בפיתוח בין לאומי – שיתוף הפעולה מתמקד ביצוא מודלים שפותחו בטופז כגון "בית ספר מוזות" ומיזמי אומנות של "אינספריישן". העמותה חולקת מרחב משרדי משותף וחלק מהמתנדבים משותפים לשני הארגונים.
נתן – עמותה העוסקת בסיוע הומניטרי לאזורי אסון. העמותה מופעלת כיום באמצעות ברית עולם ועושה שיתופי פעולה נוספים עם טופז.
הפורום האקדמי ליזמות חברתית – שותפות של שלושה ארגונים: בית הספר לעבודה סוציאלית באוניברסיטת תל אביב, ארגון שתיל וטופז. הפורום עוסק בארגון שולחנות עגולים וכנסים בתחום היזמות מתוך רצון להעלות את איכות הדיון אודות סוגיות בתחום היזמות החברתית.